Bueno yo sólo comentarte que el único "problema" que yo he tenido con este juego (por llamarlo de alguna manera, ya que tampoco es ningún problema) es lo que dices del coleccionable, digo que tampoco es un problema porque el coleccionable una vez lo cojas te lo da por contado, cuando hagas un punto de guardado, con lo cual tampoco es nada grave, como lo del trofeo del nivel de dificultad que te ha pasado, que eso sí es grave.
Sí es curioso que hayamos cogido el coleccionable y cuando repites esa parte te aparezca otra vez la pantallita de dónde está el coleccionble, vayas y no esté (porque ya lo cogimos) pero se queda en anécdota, ya que una vez lo hayas cogido y hayas hecho el guardado te cuenta y no hay problema, yo repetí ese capítulo un par de veces, lo tenía todo completo, y siempre me pasaba eso, que la pantallita estaba pero el coleccionable no.
Sobre lo de la dificultad, si no has cambiado de dificultad en ningún momento no sé por qué no te ha saltado el trofeo, yo hice lo mismo que tú, osea me pasé la historia antes de repetir capítulos para buscar coleccionables, etc, sin cargar punto de control tampoco y me saltaron los trofeos seguiditos al acabar la historia, es más lo que me sorprendió es que el primero en saltarme fue el de la máxima dificultad, que de normal suele saltar el de dificultad más baja y el último el de la más alta, en este fue al revés.
De todas formas no te des por vencido, que el juego se pasa en un plis, y si encima sólo vas a saco con las misiones más corto aún se hace, y como ya sabes lo que hay que hacer te resultará más fácil pasarte el juego.
Saludos.