No, para quitar el audio necesitaras el
mkvextractGUI. Con este programa tendras que extraer las pistas (audio, video y subs) que SI queres quedarte, y entonces volver a meterlas en un .mkv (todo con el mismo programa).
Lo de partirlo en varias partes, no te sabria decir, porque no lo he hecho nunca, pero con algun programa de edicion de video creo que podras hacerlo. (quizas el virtualdub no se..)
PD: las pistas de audio no creas que te van a bajar muucho el tamaño, a lo mejor unos 100 o 200 MB.