Todas las naves, no vehiculos chorra jaja. Las naves son las que puedes seleccionar para ir al exterior.
Lo de las batallas especiales esperate a ver a completar el juego, y despues deberia dejarte. Aunque hay un par de misiones que tienes que destruir cosas plateadas y doradas, creo recordar, y necesitas naves especiales, que puedan destruir esos elementos.
Los prisioneros puede que sea porque no tienes los personajes adecuados, de eso ya no me acuerdo que la guia la hice hace 3 años... lo siento
EDITO: He reformado la guia porque con el cambio visual se veia muy mal, y a parte la mitad de las imagenes no tiraban