Durante un tiempo, Marte fue libre. Después de la liberación del planeta por la EDF, encabezada por Alec Mason, los colonos de Marte, por primera vez en sus vidas, controlaban su destino en el Planeta Rojo. No sin pasar adversidades, los colonos prosperaron. Por primera vez en Marte, había paz…
50 años después, un nuevo enemigo no sólo amenaza la libertad de los colonos, sino su existencia. Adam Hale, enemigo de la familia Mason, ha destruido el Terraformer, la única cosa que mantenía la superficie del planeta habitable, forzando a los ciudadanos de Marte a vivir bajo tierra.
Ahora, los ciudadanos de cada facción de Marte unirán sus fuerzas de nuevo contra esta nueva amenaza. Kara, una contrabandista Marauder, Winters, un experimentado sargento de la Red Faction, y Darius, el nieto de Alec, se unirán para liberar Marte en Red Faction: Armageddon.