LEGO Marvel Super Heroes cuenta con una historia original en la que Nick Furia, junto a otros personajes como Iron Man, Hulk, Thor, Spider-Man, Wolverine y otros muchos superhéroes del universo Marvel deberán salvar la Tierra de amenazas como Loki, Galactus, o Devourer of the Worlds. Todo ello aderezado con las aventuras y el humor que caracterizan a la saga LEGO.