En Flower, el entorno, que en la mayoría de los juegos permanece en segundo plano, está tan presente que llega a convertirse en el verdadero protagonista. El jugador escapa del estresante mundo exterior y viaja por paisajes hermosos y vívidos, durante el que va cambiando de entornos y explorando la naturaleza que le rodea.
Al controlar el viento, el jugador podrá guiar y recoger pétalos, mediante la interacción con otras flores y con el entorno. El viaje y los objetivos cambian en cada nivel, pero en todos será necesario volar, explorar e interactuar con el nivel. Utilizando los sencillos controles del mando inalámbrico SIXAXIS™, el jugador podrá guiar al pétalo principal y reunir más mientras se mueve serenamente por el entorno y hace que el mundo que aparece en pantalla cambie.