A finales de la década de los 90, los jóvenes Jesse Lacey, Garrett Tierney y Brian Lane comenzaban en el mundo de la música con la banda The Rookie Lot, una banda de post-hardcore de la zona de Long Island junto a Brandon Reilly, guitarrista también de bandas como The Movielife y Nightmare of You. Tras la desintegración de esta banda, Lacey se enrola en Taking Back Sunday, otra banda de post-hardcore también de la escena de Long Island. Graba con ellos su primer material no oficial, una demo, y deja la banda, supuestamente, por problemas con John Nolan y Adam Lazzara, los líderes de TBS. Apenas había transcurrido un año, pero durante ese tiempo Lacey vio como se hundían sus proyectos con The Rookie Lot y Taking Back Sunday. Comienza a tocar con Lane, ex compañero suyo en Rookie Lot y poco después se les unieron Tierney y Vincent "Vin" Accardi para completar el grupo. El nombre que eligieron para la banda fue Brand New gracias a un amigo. Su primer lanzamiento fue una demo de 4 canciones producida por Mike Sapone y con ella empezaron a dar conciertos por Long Island junto a bandas como Glassjaw o Midtown.
En 2001 firman con el sello independiente Triple Crown Records para grabar su álbum debut, Your Favorite Weapon. El álbum era una mezcla de canciones de sus demos y de nuevas composiciones, todas ellas dotadas de un sonido punk pop y cuyas letras están centradas en los problemas típicos de la adolescencia. La banda comienza a ganarse un nutrido número de seguidores y comienza a dar conciertos con las dos agrupaciones más importantes del rock alternativo en Long Island en ese momento, como Glassjaw y los "viejos conocidos" de Taking Back Sunday, con quienes comienza a retomar la relación de amistad que se perdió tras la marcha de Lacey. Progresivamente comienzan a girar con otras bandas del resto de la geografía estadounidense como Good Charlotte, Less Than Jake, New Found Glory, Incubus, Dashboard Confessional o Finch. El primer y único single de este trabajo fue "Jude Law and a Semester Abroad", que tiene una gran acogida en los canales temáticos MTV2 y Fuse TV.
Un año más tarde, en 2002, graban un split junto a sus compañeros en Triple Crown, Safety in Numbers, donde incluyen dos canciones, "Moshi Moshi" y "Am I Wrong", versión de Love Split Love.