Te refieres al xperia neo, o neo V?
La diferencia que mas se ve a simple vista es que el arc S es un poco mas grande y mas finito, pero poco mas. El arc S solo tiene una camara mientras que los neo tienen camara frontal, que para los que usan skype y videollamadas supongo que les servira.
Si te refieres al xperia Neo, la conexion a internet es mucho mas rapida que el arc S, ademas que tiene usb 2.1 y el arc S tiene 1.0. El micro del arc S es de 1,4ghz pero el del neo es de 1ghz, por lo que tampoco es lento. La navegacion en ambos moviles es lenta, aunque tecnicamente el arc S va un pelo mas rapido, pero su velocidad media no dejan de ser lentos.
Si te referias al xperia Neo V, bueno, en realidad esta version es casi lo mismo que el neo, pero con una camara de 5mp.
si tuvieras que pillarte uno que no es el caso, lo que decantaria la balanza es el precio, donde sale ganando neo, pero en tu caso que ya los tienes pues quedate con el que mas te guste, por lo menos yo no veo mucha diferencia vaya xd